La méthanisation est le processus de décomposition des déchets par des bactéries en absence d’air. Elle peut avoir lieu naturellement dans certains milieux (les marais) ou peut être stimulée artificiellement dans des équipements prévus à cet effet. Elle permet la production de biogaz qui peut être utilisé pour produire de l’électricité et de la chaleur (grâce à une unité de cogénération), injecté dans les réseaux de gaz naturel après une étape d’épuration (le biogaz devient alors du biométhane), ou transformé en carburant sous forme de gaz naturel véhicule (GNV).

En bout de chaîne de valorisation énergétique, le résidu appelé « digestat » peut être ensuite valorisé comme fertilisant pour l’agriculture. Pour la matière organique d’origine animale (effluents bovins majoritairement), l’épandage en terre agricole est la solution de valorisation. Le traitement intermédiaire en unité de méthanisation n’a pas d’incidence sur la qualité de l’amendement.